(1) A rovarok antimikrobiális peptidjei: A rovarok alkotják az élőlények legnagyobb csoportját, és az általuk termelt antimikrobiális peptidek száma óriási. A mai napig több mint 200 típusú rovar antimikrobiális peptidet azonosítottak nyolc rendben, köztük a Lepidoptera, Diptera, Coleoptera és Odonata; nevezetesen 40 antimikrobiális peptid gént izoláltak egyedül a selyemhernyóból (*Bombyx mori*).
(2) Emlős antimikrobiális peptidek: A Cecropin P1 emlős antimikrobiális peptidet először 1989-ben izolálták sertés vékonybeléből. Jelenleg legalább 18 típust izoláltak sertésből, 30-at juhból és 30-at szarvasmarhából.
(3) Kétéltűek antimikrobiális peptidjei: A kétéltűeknek csupasz bőrük van, amely több funkciót is ellát. Bőrváladékuk sokféle biológiai aktivitással rendelkező bioaktív peptidet tartalmaz; ezek többsége antimikrobiális tulajdonságokat mutat. A természetes védekezés ősi és hatékony formáját képviselve általában antimikrobiális peptidek közé sorolják őket.
(4) Antimikrobiális peptidek halakból, puhatestűekből és rákfélékből: A pardaxin, egy 35-amino-sav-maradékból álló peptid, amelyet a mózesi nyelvhalból (*Pardachirusatus*) izoláltak 1986-ban, az első antimikrobiális peptid, amely halakból izolált mármaramikationt. -membránpermeabilizációra képes spirális szerkezet. Ionos neurotoxinként működik, és számos származékos peptidet fejlesztettek ki, amelyek erősebb antimikrobiális hatást{8}} és alacsonyabb hemolitikus aktivitást mutatnak, mint a melittin.
(5) Növényi antimikrobiális peptidek: A növények a rovarokban és emlősökben található defenzinekhez szerkezetileg hasonló antimikrobiális peptideket is termelnek; ezeket növényi defenzineknek nevezik. A legtöbb növényi antimikrobiális peptid rendkívül aktív a növényi kórokozókkal szemben, bár némelyik Gram{2}}pozitív és Gram{3}}negatív baktériumokra, gombákra, élesztőgombákra és emlőssejtekre is toxicitást mutat. A tioninok voltak az első antimikrobiális peptidek, amelyeket növényekből izoláltak.
(6) Bakteriális antimikrobiális peptidek: Bakteriocinként is ismertek, ezek közé tartoznak a kationos és a semleges peptidek is, és Gram{1}}pozitív és Gram{2}}negatív baktériumok is kiválasztják őket. A baktériumokban négyféle antimikrobiális peptidet azonosítottak: bacitracin, gramicidin S, polimixin E és nizin.
